MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 2874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015955	AG	3	6	21	26	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015955	AAT	2	6	922	927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015955	TAC	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015955	TC	3	6	1005	1010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015955	ACC	2	6	1087	1092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015955	ATA	2	6	1120	1125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015955	AAATGA	2	12	1137	1148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015955	CAAC	2	8	1202	1209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015955	ATA	2	6	1263	1268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015955	GAT	2	6	1311	1316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015955	TATAT	2	10	1342	1351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015955	GAG	2	6	1360	1365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015955	TA	3	6	1441	1446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015955	ATA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015955	TTA	2	6	2183	2188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015955	GTA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015955	AT	3	6	2238	2243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015955	ATTT	2	8	2278	2285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015955	AAAG	2	8	2867	2874	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015955	AT	3	6	3105	3110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015955	TCG	2	6	3233	3238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015955	ATA	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015955	AGT	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015955	TAT	2	6	5526	5531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015955	ACT	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015955	GGT	2	6	5551	5556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015955	GAC	2	6	5583	5588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015955	GA	3	6	5590	5595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015955	TCC	2	6	5619	5624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015955	CAGT	2	8	5648	5655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015955	CAG	2	6	5661	5666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015955	ATT	2	6	5686	5691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015955	AGC	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015955	A	6	6	5747	5752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015955	GGA	2	6	7810	7815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015955	GGTC	2	8	7857	7864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015955	TC	3	6	7863	7868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015955	TTCGG	2	10	7915	7924	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015955	GTC	2	6	8892	8897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015955	GCC	2	6	8937	8942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015955	ATC	2	6	8946	8951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015955	ATG	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015955	GATAA	2	10	8993	9002	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015955	GAC	2	6	9016	9021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015955	TGG	2	6	9034	9039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015955	TTA	2	6	9094	9099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015955	TCA	2	6	10123	10128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015955	ATT	2	6	10206	10211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015955	TGA	2	6	10224	10229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015955	CATC	2	8	10708	10715	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015955	CTG	2	6	10746	10751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015955	TAA	2	6	12709	12714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015955	ATC	2	6	12746	12751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015955	AAG	2	6	12789	12794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015955	GAA	2	6	12797	12802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015955	ATT	2	6	12860	12865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015955	ATA	2	6	12875	12880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015955	TTA	2	6	12897	12902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015955	TG	3	6	12909	12914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015955	CT	3	6	15081	15086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015955	TTAA	2	8	17206	17213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015955	AGT	2	6	17262	17267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015955	AC	4	8	17284	17291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015955	TAG	2	6	17311	17316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015955	CTC	2	6	17368	17373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015955	ATC	2	6	17386	17391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015955	AT	3	6	27933	27938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015955	CAA	2	6	27973	27978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015955	CA	3	6	27991	27996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015955	A	6	6	28031	28036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015955	TA	3	6	28118	28123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015955	TAAAA	2	10	28156	28165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015955	GTA	2	6	28173	28178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015955	AGA	2	6	28180	28185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015955	GGA	2	6	28322	28327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015955	GAC	2	6	28335	28340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015955	AAT	2	6	28341	28346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015955	TAC	2	6	28347	28352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015955	AAGC	2	8	28387	28394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015955	CTG	2	6	28408	28413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015955	AGACA	2	10	29660	29669	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015955	ACC	2	6	29786	29791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015955	AAT	2	6	29815	29820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015955	TAAT	2	8	29921	29928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015955	GGTT	2	8	30010	30017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015955	ACT	2	6	30105	30110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015955	TTTTA	2	10	30123	30132	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015955	TAAA	2	8	30160	30167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015955	TGG	2	6	30170	30175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015955	GCT	2	6	31048	31053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015955	TAT	2	6	31098	31103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015955	GTA	2	6	32964	32969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015955	TTTG	2	8	33023	33030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015955	TAA	2	6	33079	33084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015955	TCC	2	6	34202	34207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015955	TCT	2	6	34226	34231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015955	GAA	2	6	34285	34290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015955	CGC	2	6	34292	34297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015955	CTT	2	6	34302	34307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015955	ATGA	2	8	34314	34321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015955	AGT	2	6	34454	34459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015955	CAA	2	6	35869	35874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015955	ACT	2	6	35931	35936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015955	CGA	2	6	36200	36205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015955	GA	3	6	36204	36209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015955	ACGG	2	8	36213	36220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015955	GCTGTC	2	12	36232	36243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015955	GGC	2	6	36244	36249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015955	GCC	2	6	36255	36260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015955	CACT	2	8	36277	36284	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015955	TCGG	2	8	36297	36304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015955	AGCA	2	8	37481	37488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015955	TA	3	6	37791	37796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015955	TTG	2	6	39351	39356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015955	CAC	2	6	39418	39423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015955	TATT	2	8	39439	39446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015955	CAT	2	6	39447	39452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015955	CATACC	2	12	39492	39503	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015955	CGT	2	6	40231	40236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015955	CTG	2	6	53434	53439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015955	TTTG	2	8	53449	53456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015955	CTG	2	6	53489	53494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015955	AT	3	6	57919	57924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015955	ACCAGA	2	12	57980	57991	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015955	GA	3	6	58092	58097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015955	AGC	2	6	58112	58117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015955	TAT	2	6	58190	58195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015955	TCG	2	6	58204	58209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015955	TCT	2	6	58247	58252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015955	AAAG	2	8	58299	58306	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015955	GCC	2	6	58329	58334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015955	CT	3	6	58337	58342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015955	ACT	2	6	58374	58379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015955	GGT	2	6	58421	58426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015955	C	6	6	58467	58472	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
136	NC_015955	CGCC	2	8	59002	59009	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_015955	GAGT	2	8	59022	59029	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015955	GGC	2	6	59037	59042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015955	TCG	2	6	59089	59094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015955	GC	3	6	59692	59697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015955	GCG	2	6	59708	59713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015955	GAC	2	6	60433	60438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015955	CAG	2	6	60510	60515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015955	CGA	2	6	60516	60521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015955	CGA	2	6	60532	60537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015955	GCG	2	6	60903	60908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_015955	TCG	2	6	120631	120636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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